RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SPRED1Q7Z699 444 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 UNC5CLQ8IV45 518 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KBTBD2Q8IY47 623 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 AADATQ8N5Z0 425 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 IQUBQ8NA54 791 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DNERQ8NFT8 737 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SMARCE1Q969G3 411 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ABHD1Q96SE0 405 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC77Q9BR77 488 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DPH1Q9BZG8 443 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD2Q9GZV1 360 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KLC2Q9H0B6 622 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 USP44Q9H0E7 712 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 POFUT1Q9H488 388 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SRRDQ9UH36 339 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 AMACRQ9UHK6 382 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TLK1Q9UKI8 766 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH7Q9ULB5 785 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CDY2AQ9Y6F7 541 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MYPNQ86TC9 1320 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.66□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KDRP35968 1356 aa3.65□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 XKRY2A2RUG3 117 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DENND3A2RUS2 1198 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ACOD1A6NK06 481 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C76A6NM76 312 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 VGLL3A8MV65 326 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 H0Y8G0 127 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMD9O00233 223 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CTDSP2O14595 271 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP2A1O14983 1001 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MAPK13O15264 365 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNQ3O43525 872 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CA12O43570 354 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ERLIN1O75477 346 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RASSF9O75901 435 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ALDH1A2O94788 518 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NTSR2O95665 410 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HMGCRP04035 888 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AMY2AP04746 511 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBBP07437 444 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA6P08133 673 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT3P12035 628 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RARGP13631 454 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF3P17036 446 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AMY2BP19961 511 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TACR2P21452 398 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GLRA2P23416 452 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MCM3P25205 808 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPN3P26045 913 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCND2P30279 289 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms