RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 CCDC89Q8N998 374 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 KRT35Q92764 455 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 GATA6Q92908 595 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 IGSF8Q969P0 613 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 ZNF599Q96NL3 588 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 IER2Q9BTL4 223 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 CHRDQ9H2X0 955 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 SUN2Q9UH99 717 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-218ENST00000550159 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 RASA4BC9J798 803 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FAM72CH0Y354 149 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 GIPC1O14908 333 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 RASA4O43374 803 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ALDH1A2O94788 518 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ZNF806P0C7X5 589 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PYGMP11217 842 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CES1P23141 567 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CXCR5P32302 372 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CXCL12P48061 93 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PEX5P50542 639 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 TUBB4BP68371 445 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ITKQ08881 620 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 MMRN1Q13201 1228 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SEMA3BQ13214 749 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 GRM3Q14832 879 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CA9Q16790 459 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 EOGTQ5NDL2 527 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 MANEALQ5VSG8 457 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 BBS12Q6ZW61 710 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 C14orf80Q86SX3 495 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FAM72BQ86X60 149 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CEP112Q8N8E3 955 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 TERB1Q8NA31 727 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FAM71BQ8TC56 605 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FAF2Q96CS3 445 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 VAT1Q99536 393 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 FBRSQ9HAH7 460 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 HPS4Q9NQG7 708 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SEPT3Q9UH03 358 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 WASF3Q9UPY6 502 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 A0A0U1RQJ8 604 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CCDC188H7C350 402 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 DCLK1O15075 740 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 KDELR3O43731 214 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 GREM1O60565 184 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CNTN5O94779 1100 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 TCF4P15884 667 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CCNCP24863 283 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 CSKP41240 450 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 SATB1Q01826 763 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 IL10RBQ08334 325 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 LMAN2Q12907 356 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PON2Q15165 354 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 ALFQ53S48 1182 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-218ENST00000550159 MARC1Q5VT66 337 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms