RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 PGS1Q32NB8 556 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GPR107Q5VW38 600 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 METTL7BQ6UX53 244 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GIMAP5Q96F15 307 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MAP6Q96JE9 813 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KCNK16Q96T55 309 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SGTAO43765 313 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PRKACAP17612 351 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 EPHA3P29320 983 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GNA15P30679 374 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 AQP5P55064 265 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ECT2LQ008S8 904 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CDC20Q12834 499 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TRAF2Q12933 501 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PMS2P3Q13401 168 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RAB39AQ14964 217 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PERM1Q5SV97 790 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KRT80Q6KB66 452 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CGRRF1Q99675 332 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PKP2Q99959 881 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SNTG2Q9NY99 539 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 STMN3Q9NZ72 180 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GRIA3P42263 894 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CENPCQ03188 943 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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TRPS1-209ENST00000519674 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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TRPS1-209ENST00000519674 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RNF149Q8NC42 400 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZW10O43264 779 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DYRK3O43781 588 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MSCO60682 206 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SPAG6O75602 509 aa8.6□□□□□ -1.03
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TRPS1-209ENST00000519674 GJB1P08034 283 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TGFB3P10600 412 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CDH1P12830 882 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CCNA2P20248 432 aa8.6□□□□□ -1.03
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TRPS1-209ENST00000519674 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CENPFP49454 3210 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 EVPLQ92817 2033 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LPXNO60711 386 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 BCL10O95999 233 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MCF2P10911 925 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KRT3P12035 628 aa8.59□□□□□ -1.03
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