RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LGMNQ99538 433 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CHRDQ9H2X0 955 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PRRT4C9JH25 899 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 J3KR12 359 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LIASO43766 372 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MAFKO60675 156 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MTAPQ13126 283 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SNX1Q13596 522 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM215Q68D42 235 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 IER2Q9BTL4 223 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 A0A0A0MRY4 1105 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZMPSTE24O75844 475 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 NEBLO76041 1014 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 EGFP01133 1207 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 NNMTP40261 264 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ST8SIA6P61647 398 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ARF5P84085 180 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SLC20A2Q08357 652 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LINGO4Q6UY18 593 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PRELID2Q8N945 189 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF599Q96NL3 588 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM20-201ENST00000506197 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 MTSS1O43312 755 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 PHF2O75151 1096 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 BBS5Q8N3I7 341 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 FATE1Q969F0 183 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 PDFQ9HBH1 243 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CFAP69A5D8W1 941 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC188H7C350 402 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 MATN3O15232 486 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CHRNB1P11230 501 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CLCN6P51797 869 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 SEC13P55735 322 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC32Q14392 662 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CYP1B1Q16678 543 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO43Q4G163 708 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 TSSK4Q6SA08 328 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 MNS1Q8NEH6 495 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC114Q96M63 670 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.44■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 K7EQS6 105 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 NPC1O15118 1278 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 KCNN4O15554 427 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 ITGAVP06756 1048 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 CCNB1P14635 433 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 VAV1P15498 845 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 RBL1P28749 1068 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 RENBPP51606 427 aa20.43■□□□□ 0.86
SMIM20-201ENST00000506197 LMNB2Q03252 620 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms