RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PQLC1Q8N2U9 271 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LPPQ93052 612 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 AP4S1Q9Y587 144 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TK2O00142 265 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PPEF2O14830 753 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 INPP4BO15327 924 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TSPAN3O60637 253 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 IDH3AP50213 366 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SEMA5AQ13591 1074 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ANO7Q6IWH7 933 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GPR141Q7Z602 305 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 BHMTQ93088 406 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RHOJQ9H4E5 214 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SPON1Q9HCB6 807 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PKP3Q9Y446 797 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PAPPAQ13219 1627 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DLDP09622 509 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 UQCRBP14927 111 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LRPAP1P30533 357 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 NEK3P51956 506 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LIMK2P53671 638 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ADRM1Q16186 407 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FAM35AQ86V20 835 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RBBP8Q99708 897 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 NPAS2Q99743 824 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 IRF1P10914 325 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PEX2P28328 305 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GRM3Q14832 879 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM86AQ8N2M4 240 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DLG3Q92796 817 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SEPHS2Q99611 448 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GPR63Q9BZJ6 419 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 NFKBIEO00221 500 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ATG7O95352 703 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TFEBP19484 476 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 HUNKP57058 714 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ACTR3P61158 418 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 MAXP61244 160 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RTKNQ9BST9 563 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 COLEC11Q9BWP8 271 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DERAQ9Y315 318 aa13.44□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 HCRTO43612 131 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RAMP2O60895 175 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ENDOD1O94919 500 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 AP2A1O95782 977 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SCNN1BP51168 640 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TBX4P57082 545 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PQLC3Q8N755 202 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SYTL2Q9HCH5 934 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GLI3P10071 1580 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TTC36A6NLP5 189 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SPTLC1O15269 473 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ASRGL1Q7L266 308 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RIN3Q8TB24 985 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DSEQ9UL01 958 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 C2orf81A6NN90 581 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 VPS26AO75436 327 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FASP25445 335 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CLDN10P78369 228 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 AMIGO2Q86SJ2 522 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM110Q86TL2 294 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJC28Q9NX36 388 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms