RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CBWD5-231	ENST00000495615	LRP12	Q9Y561	859 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CBWD5-231	ENST00000495615	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CBWD5-231	ENST00000495615	OR6C68	A6NDL8	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CBX6	O95503	412 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MMP3	P08254	477 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MYZAP	P0CAP1	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ARSA	P15289	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	YWHAQ	P27348	245 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TNFSF8	P32971	234 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GJC1	P36383	396 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ERV3-1	Q14264	604 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615		Q5PR19	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	BICD2	Q8TD16	824 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MIB2	Q96AX9	1013 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0A0MQY5	61 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	BECN2	A8MW95	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615		I6L893	689 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PEX12	O00623	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	DDAH2	O95865	285 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	IL1A	P01583	271 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RASSF2	P50749	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PGGT1B	P53609	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TMPRSS3	P57727	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SELENOV	P59797	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	IL13RA2	Q14627	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TMC8	Q8IU68	726 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GHDC	Q8N2G8	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CD180	Q99467	661 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ISCU	Q9H1K1	167 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CD207	Q9UJ71	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CDH22	Q9UJ99	828 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ICK	Q9UPZ9	632 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MST1R	Q04912	1400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RFX2	P48378	723 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	UBE3A	Q05086	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GJB7	Q6PEY0	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	WASF1	Q92558	559 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TWNK	Q96RR1	684 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1B0GVT2	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	KLK10	O43240	276 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GUCY1B2	O75343	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	LCAT	P04180	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP1A2	P05177	515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	NGFR	P08138	427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR12	P47775	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	MTNR1A	P48039	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms