RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 FGF14Q92915 247 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TDP1Q9NUW8 608 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GDE1Q9NZC3 331 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFP69BQ9UJL9 534 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RASA4BC9J798 803 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 LEFTY2O00292 366 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RASA4O43374 803 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC22O60826 627 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASMTLO95671 621 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MARCKSL1P49006 195 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBX4P57082 545 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SESN3P58005 492 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KYNUQ16719 465 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMTNL2Q2TAL5 461 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCYL2Q6P3W7 929 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CEP128Q6ZU80 1094 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH3RF2Q8TEC5 729 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GATA6Q92908 595 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMARCD2Q92925 531 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RRN3Q9NYV6 651 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CFAP97Q9P2B7 532 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASIC3Q9UHC3 531 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 C2CD4DB7Z1M9 353 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAP3K7O43318 606 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GSTT1P30711 240 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 AP1B1Q10567 949 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJC3Q13217 504 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RCN1Q15293 331 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TANGO2Q6ICL3 276 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PARM1Q6UWI2 310 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CYP4X1Q8N118 509 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF398Q8TD17 642 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TKTL2Q9H0I9 626 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLHL11Q9NVR0 708 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBK1Q9UHD2 729 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP18Q9UMW8 372 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SNX10Q9Y5X0 201 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNU1A8MYU2 1149 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CBX6O95503 412 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PYGMP11217 842 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PFKLP17858 780 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCR1P32246 355 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GJC1P36383 396 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNJ1P48048 391 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF77Q15935 545 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CA9Q16790 459 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FYB2Q5VWT5 728 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 DENND1CQ8IV53 801 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GRK7Q8WTQ7 553 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 C10orf82Q8WW14 230 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 STMN2Q93045 179 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 P2RY11Q96G91 374 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZWILCHQ9H900 591 aa12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTC28Q96AY4 2481 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTC36A6NLP5 189 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SOBPA7XYQ1 873 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHKAP35790 457 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINB4P48594 390 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 COG7P83436 770 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RING1Q06587 406 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDK4Q16654 411 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PYROXD2Q8N2H3 581 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 BBOF1Q8ND07 529 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD101Q93033 1021 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF34Q969K3 372 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYEOVQ96EZ4 313 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KXD1Q9BQD3 176 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 BTBD10Q9BSF8 475 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 WDCPQ9H6R7 721 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 NINJ2Q9NZG7 142 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATXN10Q9UBB4 475 aa12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A1B0GVG6 124 aa12.08□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FOXO6A8MYZ6 492 aa12.08□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPOPO43791 374 aa12.08□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PAGE1O75459 146 aa12.08□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GAS8O95995 478 aa12.08□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 F9P00740 461 aa12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms