RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CNTROBQ8N137 903 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FAR1Q8WVX9 515 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 USP6NLQ92738 828 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ITPAQ9BY32 194 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GHITMQ9H3K2 345 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 DPPA5A6NC42 116 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRC-212ENST00000491302 CXorf65A6NEN9 183 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 DDAH2O95865 285 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GALTP07902 379 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CD72P21854 359 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NFKBIAP25963 317 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN9P43378 593 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 INHBCP55103 352 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO43Q4G163 708 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CDC73Q6P1J9 531 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FAM160B2Q86V87 743 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1456Q9P272 454 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 VPS28Q9UK41 221 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TACC1O75410 805 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ATG9BQ674R7 924 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N1X5 172 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PDILTQ8N807 584 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MAP4K1Q92918 833 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCE1Q969G3 411 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PIP5K1AQ99755 562 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 EHD2Q9NZN4 543 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 POLG2Q9UHN1 485 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 IRF1P10914 325 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 KLRC2P26717 231 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD13P35453 343 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 YPEL5P62699 121 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CUL4AQ13619 759 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TAF11Q15544 211 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NEK9Q8TD19 979 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 HIPK3Q9H422 1215 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NLKQ9UBE8 527 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MST1RQ04912 1400 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PRRG2O14669 202 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TGFB1I1O43294 461 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 YWHAQP27348 245 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ARSFP54793 590 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NUCB1Q02818 461 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 AOX1Q06278 1338 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRC-212ENST00000491302 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CDH22Q9UJ99 828 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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