RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 DMAC2Q9NW81 257 aa6.74□□□□□ -1.33
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PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ALLCQ8N6M5 410 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.72□□□□□ -1.33
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