RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAAF3Q8N9W5 541 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS50Q96JG6 964 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TBCBQ99426 244 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SIP14410 1827 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM149AA5PLN7 773 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TPST1O60507 370 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 MAFO75444 373 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 MLNP12872 115 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP1A4Q13733 1029 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SPIDRQ14159 915 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 DPYSL2Q16555 572 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PID1Q7Z2X4 250 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CLEC14AQ86T13 490 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 LSMEM2Q8N112 164 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF567Q8N184 647 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NRBP2Q9NSY0 501 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF19AQ9NV58 838 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PRORSD1PA6NEY8 169 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A2O15244 555 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 BMP10O95393 424 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 C8BP07358 591 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 LCP1P13796 627 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGEA12P43365 314 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CLCN3P51790 818 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB15P59190 212 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GRM3Q14832 879 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 AMHR2Q16671 573 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 C7orf31Q8N865 590 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ASB9Q96DX5 294 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS39Q96JC1 886 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 DRC3Q9H069 523 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 COL4A5P29400 1685 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PPW3 197 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 DPYSL4O14531 572 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NRP1O14786 923 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 AKAP10O43572 662 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SERPINB7O75635 380 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ALDH2P05091 517 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 STAG3L1P0CL83 205 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 HMGCS2P54868 508 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NAB1Q13506 487 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR107Q5VW38 600 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 LIPMQ5VYY2 423 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR180Q86V85 440 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 HM13Q8TCT9 377 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CPB2Q96IY4 423 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS45Q9NRW7 570 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GTSE1Q9NYZ3 720 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SELENONQ9NZV5 590 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 OXCT1P55809 520 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RELAQ04206 551 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TGFBIQ15582 683 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CHSY3Q70JA7 882 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CXorf38Q8TB03 319 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ISL2Q96A47 359 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRAC1Q9NRG0 131 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC38A7Q9NVC3 462 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 UBP1Q9NZI7 540 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CDH7Q9ULB5 785 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NEMP2A6NFY4 417 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 J3QRK9 145 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 WNT10BO00744 389 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GIPC1O14908 333 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms