RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	CA4	P22748	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DNAJB1	P25685	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PSMB4	P28070	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GCA	P28676	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GPC1	P35052	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PBX3	P40426	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CCT5	P48643	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	POLD2	P49005	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GPR15	P49685	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GATM	P50440	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CDH4	P55283	916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	OXCT1	P55809	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	HTRA3	P83110	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	UBE3A	Q05086	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	MGAT5	Q09328	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ITIH4	Q14624	930 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	UGP2	Q16851	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DPF3	Q92784	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PEX13	Q92968	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CPNE1	Q99829	537 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	VPS11	Q9H270	941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971		A0A1B0GVM2	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971		A0A1W2PRU2	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-206	ENST00000466971	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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