RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 EID2Q8N6I1 236 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 OR7D4Q8NG98 312 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ARRDC3Q96B67 414 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQU0 124 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 GFPT2O94808 682 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 TPM2P07951 284 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 GLDCP23378 1020 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ETFBP38117 255 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ARF5P84085 180 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 GNA12Q03113 381 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 BNIP3Q12983 259 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF284Q2VY69 593 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 STRADAQ7RTN6 431 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 HORMAD1Q86X24 394 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 EMC1Q8N766 993 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CHST14Q8NCH0 376 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 VPS16Q9H269 839 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 WASF2Q9Y6W5 498 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS20P59510 1910 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CBX4O00257 560 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNB2P17787 502 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SDC4P31431 198 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 HNF1BP35680 557 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN9P43378 593 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 MAPKAPK2P49137 400 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ATP11AP98196 1134 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 PLPP6Q8IY26 295 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 LEFTY1O75610 366 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB7P26010 798 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 AKT2P31751 481 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ADRA1BP35368 520 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 NEK3P51956 506 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC3Q13217 504 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC14Q49A88 953 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ARSIQ5FYB1 569 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP14Q86W24 1093 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 IFT43Q96FT9 208 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SPON2Q9BUD6 331 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 NEU3Q9UQ49 428 aa21.41■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FAM149AA5PLN7 773 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 RNF103O00237 685 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 EPHB6O15197 1021 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 AP1G1O43747 822 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 THEGLP0DJG4 465 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 RHOQP17081 205 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CKMT2P17540 419 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 STAT1P42224 750 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 KLK7P49862 253 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 PTP4A2Q12974 167 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC157Q569K6 752 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CARD16Q5EG05 197 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 DRC7Q8IY82 874 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FAM170AA1A519 330 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SLC31A1O15431 190 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CD160O95971 181 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ADRB3P13945 408 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PRLRP16471 622 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ACP1P24666 158 aa21.39■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 L1CAMP32004 1257 aa21.39■■□□□ 1.01
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