RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.97■□□□□ 0.63
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