RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 NPWQ8N729 165 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 NETO1Q8TDF5 533 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SNX19Q92543 992 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 OMDQ99983 421 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 EDEM2Q9BV94 578 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CEP44Q9C0F1 390 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC19Q9H756 370 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SGK2Q9HBY8 427 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa15.23■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 KDELR3O43731 214 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CFIP05156 583 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CHRNA3P32297 505 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 HOXD12P35452 270 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 GJC1P36383 396 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ADPRHP54922 357 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SLC20A2Q08357 652 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SERINC3Q13530 473 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DPYSQ14117 519 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ARRDC3Q96B67 414 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CAPN10Q9HC96 672 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 FZD4Q9ULV1 537 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 C10orf142B7Z368 130 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DAPK3O43293 454 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 BUB1O43683 1085 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 TMCC1O94876 653 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PROSCO94903 275 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 FSBPO95073 299 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV4-34P06331 123 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 GKP32189 559 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PI4KAP42356 2102 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DPP6P42658 865 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DNA2P51530 1060 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 TAS2R40P59535 323 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CNTN1Q12860 1018 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PARP15Q460N3 678 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 BOLA3Q53S33 107 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CARD16Q5EG05 197 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 AGBL4Q5VU57 503 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 KIAA0895LQ68EN5 471 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 TEKT4Q8WW24 435 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 VOPP1Q96AW1 172 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 BIRC7Q96CA5 298 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC114Q96M63 670 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PCED1AQ9H1Q7 454 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 IL36AQ9UHA7 158 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG1-202ENST00000370287 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 H3BRJ5 948 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 J3KR12 359 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 SLC30A4O14863 429 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 LEFTY1O75610 366 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 SERPINF2P08697 491 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CD48P09326 243 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 ENGP17813 658 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms