RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 SIKE1Q9BRV8 207 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 GDF3Q9NR23 364 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ERBB2P04626 1255 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ASGR1P07306 291 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC166P0CW27 439 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PTPRNQ16849 979 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PFKFB4Q16877 469 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 IL27RAQ6UWB1 636 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ZBTB10Q96DT7 871 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 MAF1Q9H063 256 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 POMKQ9H5K3 350 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PADI3Q9ULW8 664 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC154A6NI56 674 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 INPP4BO15327 924 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 DCXO43602 365 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SELPP16109 830 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CRADDP78560 199 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ALFQ53S48 1182 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 UBE2E3Q969T4 207 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 KLQ9UEF7 1012 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ETS1P14921 441 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 AMD1P17707 334 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CXCR2P25025 360 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 GLUD2P49448 558 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFV1P49821 464 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CLCN5P51795 746 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SPDYCQ5MJ68 293 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SPRYD7Q5W111 196 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 RAET1GQ6H3X3 334 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 C16orf46Q6P387 395 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SYT12Q8IV01 421 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 FIG4Q92562 907 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 EXOC2Q96KP1 924 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 BDH2Q9BUT1 245 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ALG9Q9H6U8 611 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC19Q9H756 370 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SYBUQ9NX95 663 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 RGS5O15539 181 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 TREHO43280 583 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 LAG3P18627 525 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CDK18Q07002 472 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 NCF4Q15080 339 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF544Q6NX49 715 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 LGMNQ99538 433 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ENTPD4Q9Y227 616 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 AP4S1Q9Y587 144 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CNTNAP1P78357 1384 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ITGAVP06756 1048 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CES1P23141 567 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 HTR1BP28222 390 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PRELID2Q8N945 189 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 GNPTGQ9UJJ9 305 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 H3BQF6 201 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 MAXP61244 160 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ECM1Q16610 540 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 STRADAQ7RTN6 431 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 DHFR2Q86XF0 187 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 DPP10Q8N608 796 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 ALLCQ8N6M5 410 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-202ENST00000366197 SPACA7Q96KW9 195 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms