RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 RGL4Q8IZJ4 473 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FOXJ1Q92949 421 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 OMDQ99983 421 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CEP44Q9C0F1 390 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ETNK2Q9NVF9 386 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 TFR2Q9UP52 801 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 LNP1A1A4G5 178 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 DAPK3O43293 454 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 BUB1O43683 1085 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CD48P09326 243 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM61Q5EBN2 209 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 AFMIDQ63HM1 303 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 POLNQ7Z5Q5 900 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 DSG4Q86SJ6 1040 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 OR6K2Q8NGY2 324 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 TEKT4Q8WW24 435 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FAM131CQ96AQ9 280 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 VOPP1Q96AW1 172 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ARRDC3Q96B67 414 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CSPG4P5Q96PW8 444 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 SGK2Q9HBY8 427 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL11Q9NVR0 708 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 WASF2Q9Y6W5 498 aa27.5■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF292O60281 2723 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 H3BRJ5 948 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 TMCC1O94876 653 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 AMPD1P23109 780 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 GKP32189 559 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 HCAR3P49019 387 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ADPRHP54922 357 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CNTN1Q12860 1018 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 MMRN1Q13201 1228 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 MESDQ14696 234 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 NCEH1Q6PIU2 408 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 DNASE2BQ8WZ79 361 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 SNX19Q92543 992 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 TSC1Q92574 1164 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 BIRC7Q96CA5 298 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 PDFQ9HBH1 243 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FZD4Q9ULV1 537 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 HPCAL4Q9UM19 191 aa27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 SOWAHDA6NJG2 315 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 J3KR12 359 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FSBPO95073 299 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CFIP05156 583 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FECHP22830 423 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ARSEP51690 589 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 NDST2P52849 883 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CARD16Q5EG05 197 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ARSIQ5FYB1 569 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 AGBL4Q5VU57 503 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 RFFLQ8WZ73 363 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC114Q96M63 670 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 PANX2Q96RD6 677 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 EDEM2Q9BV94 578 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 C10orf142B7Z368 130 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV4-34P06331 123 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 IL4RP24394 825 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ARL4AP40617 200 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 CDH6P55285 790 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 WDR45BQ5MNZ6 344 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 SYCP2LQ5T4T6 812 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 FAM46CQ5VWP2 391 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0895LQ68EN5 471 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 OR14C36Q8NHC7 312 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ORAI3Q9BRQ5 295 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 PCED1AQ9H1Q7 454 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 IL36AQ9UHA7 158 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 NUMA1Q14980 2115 aa27.47■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 LEFTY1O75610 366 aa27.46■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 MTA2O94776 668 aa27.46■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 LCA5LO95447 670 aa27.46■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 HOXD12P35452 270 aa27.46■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TPGS1-201ENST00000359315 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms