RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ELMO2Q96JJ3 720 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CHP1Q99653 195 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA3CQ99985 751 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KLC2Q9H0B6 622 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EXO5Q9H790 373 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KLQ9UEF7 1012 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCL26Q9Y258 94 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IRAK3Q9Y616 596 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EVPLQ92817 2033 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LCTP09848 1927 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ISM1B1AKI9 464 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EPHB6O15197 1021 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IRAK2O43187 625 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MMP20O60882 483 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FTCDO95954 541 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TNFP01375 233 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PIGRP01833 764 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PIRTP0C851 137 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB6P18564 788 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CNR2P34972 360 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PBX1P40424 430 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC20A2Q08357 652 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SZRD1Q7Z422 152 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDKL2Q92772 493 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM136AQ96C01 138 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ABCG8Q9H221 673 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC1BQ9P126 229 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SCML2Q9UQR0 700 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CYP17A1P05093 508 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EDN1P05305 212 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDH3P22223 829 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ABL2P42684 1182 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RAD23BP54727 409 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDH4P55283 916 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 USP46P62068 366 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCZ1BP86790 482 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HTR4Q13639 388 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CST6Q15828 149 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CRY1Q16526 586 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MAP7D1Q3KQU3 841 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RASIP1Q5U651 963 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SYT12Q8IV01 421 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS58Q8IYP2 241 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA4DQ92854 862 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM159Q96B96 161 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CENPKQ9BS16 269 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FANCEQ9HB96 536 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FZD3Q9NPG1 666 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM51Q9NW97 253 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC13O75165 2243 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RASA4BC9J798 803 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf67F2Z3F1 127 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 M0QZQ0 153 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MTSS1O43312 755 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RASA4O43374 803 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RBP3P10745 1247 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IDSP22304 550 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GNPDA1P46926 289 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SEPHS1P49903 392 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GALCP54803 685 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MLIPQ5VWP3 458 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FYB2Q5VWT5 728 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PARGQ86W56 976 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GKN2Q86XP6 184 aa4.51□□□□□ -1.69
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