RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CREBZFQ9NS37 354 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF358Q9NW07 568 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC78A2IDD5 438 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 KIF3CO14782 793 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PMPCBO75439 489 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CPA3P15088 417 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ABCG1P45844 678 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TTC7BQ86TV6 843 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TLE6Q9H808 572 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MARCH5Q9NX47 278 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MTMR11A4FU01 709 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ITM2AO43736 263 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SOAT2O75908 522 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 C2P06681 752 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 GMPRP36959 345 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RENBPP51606 427 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 GPR17Q13304 367 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 GPNMBQ14956 572 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD5Q16401 504 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 CLEC14AQ86T13 490 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 FATE1Q969F0 183 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 WFS1O76024 890 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TBX18O95935 607 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RALBP11234 206 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SLC11A1P49279 550 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 GATMP50440 423 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SMARCB1Q12824 385 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TAF10Q12962 218 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 DLG2Q15700 870 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 FUT10Q6P4F1 479 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 AGAP11Q8TF27 550 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 GPR22Q99680 433 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RHOJQ9H4E5 214 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.07■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 VWA8A3KMH1 1905 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 PEX11BO96011 259 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 CCND1P24385 295 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 UGP2Q16851 508 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RANBP10Q6VN20 620 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 MIB1Q86YT6 1006 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT8Q92599 483 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA17Q96L03 361 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 GRM3Q14832 879 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ALFQ53S48 1182 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 FAM13CQ8NE31 585 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 HMCESQ96FZ2 354 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RILPQ96NA2 401 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 COMMD8Q9NX08 183 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ARMCX1Q9P291 453 aa22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 H7C4K7 107 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 CNTN5O94779 1100 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 VAPBO95292 243 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 PAMP19021 973 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 IRF9Q00978 393 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RASIP1Q5U651 963 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TNS4Q8IZW8 715 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TLK1Q9UKI8 766 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.05■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SLC12A8A0AV02 714 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 HOXA2O43364 376 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 WNT3AP56704 352 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms