RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TLE6Q9H808 572 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HACD1B0YJ81 288 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 F5H5T6 163 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 J3KR12 359 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RHOP08100 348 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PSMB4P28070 264 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ACVRL1P37023 503 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TTMPQ5BVD1 217 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF276Q8N554 614 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 AGAP11Q8TF27 550 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HMCESQ96FZ2 354 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 C5orf60A6NFR6 353 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PIAS1O75925 651 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPP3CCP48454 512 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MORF4L2Q15014 288 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TNS4Q8IZW8 715 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 BBOF1Q8ND07 529 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PLK2Q9NYY3 685 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GGA2Q9UJY4 613 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 A0A0A0MRY4 1105 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 A0A0D9SEW6 157 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 A6NNZ2 444 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MAFKO60675 156 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RHOQP17081 205 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GPR158Q5T848 1215 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 KCTD16Q68DU8 428 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA13Q96N96 652 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MSRAQ9UJ68 235 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 BPTFQ12830 3046 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SMIM23A6NLE4 172 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MOSPD3O75425 235 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PTPN2P17706 415 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 KCNJ11Q14654 390 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RIN3Q8TB24 985 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PLD4Q96BZ4 506 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HDAC11Q96DB2 347 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.61■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 DRGXA6NNA5 263 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GREM1O60565 184 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MX2P20592 715 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CAV1Q03135 178 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 BBS9Q3SYG4 887 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRF1Q5T601 910 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CNTD1Q8N815 330 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RASA4BC9J798 803 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 E7EVH7 732 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RASA4O43374 803 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 USP12O75317 370 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SMYD1Q8NB12 490 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CCNB1P14635 433 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MAGEA4P43358 317 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 NFS1Q9Y697 457 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 NCAM2O15394 837 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RIPK2O43353 540 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 OLFM2O95897 454 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CBX3Q13185 183 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HIF1AQ16665 826 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.59■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PCGF5Q86SE9 256 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms