RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 CBFA2T3O75081 653 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TOMM70O94826 608 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CFBP00751 764 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 IL1BP01584 269 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 FGFR1P11362 822 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CHRNB2P17787 502 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 GALP22466 123 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 AKT1P31749 480 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ADCY8P40145 1251 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SLC1A1P43005 524 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 MAGEA4P43358 317 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CDK7P50613 346 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PTP4A2Q12974 167 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PLD1Q13393 1074 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ZNF124Q15973 351 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 IGSF11Q5DX21 431 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 RANBP10Q6VN20 620 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CPOQ8IVL8 374 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DPP10Q8N608 796 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 LMO3Q8TAP4 145 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 MASTLQ96GX5 879 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TRABDQ9H4I3 376 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 BTBD19C9JJ37 291 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 NFKBIEO00221 500 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 EML1O00423 815 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CLIC2O15247 247 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 HAUS5O94927 633 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 GCNT3O95395 438 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PF4P02776 101 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 MYL4P12829 197 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 C6P13671 934 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ANXA8P13928 327 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 AKAP5P24588 427 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TLE2Q04725 743 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 KDSRQ06136 332 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 MAP4K2Q12851 820 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ITGA9Q13797 1035 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ZNF365Q70YC5 407 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PALB2Q86YC2 1186 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CCNJLQ8IV13 435 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 FAM20AQ96MK3 541 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 KCNK17Q96T54 332 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DCLK3Q9C098 648 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 VTA1Q9NP79 307 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 VAV3Q9UKW4 847 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DSEQ9UL01 958 aa9.29□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SNED1Q8TER0 1413 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SBF1O95248 1867 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 A0A1B0GVG6 124 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 H0YCG3 227 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 TM9SF1O15321 606 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 FFAR2O15552 330 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 GJB3O75712 270 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CCDC166P0CW27 439 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 PRG2P13727 222 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 BMI1P35226 326 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DPP6P42658 865 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 NKX3-2P78367 333 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 XIAPP98170 497 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 USP4Q13107 963 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 CCDC142Q17RM4 750 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 INSCQ1MX18 579 aa9.28□□□□□ -0.92
MMP3-201ENST00000299855 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms