RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 APC2O95996 2303 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ILVBLA1L0T0 632 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 F8VZ95 297 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ENDOD1O94919 500 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 PCDH8O95206 1070 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NOMO3P69849 1222 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ILKQ13418 452 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NAA35Q5VZE5 725 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 RETSATQ6NUM9 610 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 BNIPLQ7Z465 357 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 STK33Q9BYT3 514 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 FZD3Q9NPG1 666 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ACACAQ13085 2346 aa20.04■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 A0A087WV48 116 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 LEFTY1O75610 366 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 AKT2P31751 481 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 PROX2Q3B8N5 592 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A45Q8N413 288 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 EMC1Q8N766 993 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 HDAC8Q9BY41 377 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.03■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM38O00635 465 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SIGLEC6O43699 453 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZMPSTE24O75844 475 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ATP11AP98196 1134 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 GNA12Q03113 381 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SLC20A2Q08357 652 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 ARCQ7LC44 396 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DRC7Q8IY82 874 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 OR13H1Q8NG92 308 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CALN1Q9BXU9 219 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 CEP44Q9C0F1 390 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 AK5Q9Y6K8 562 aa20.02■□□□□ 0.8
CXCL3-201ENST00000296026 DGKAP23743 735 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ACP1P24666 158 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 DNA2P51530 1060 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 NEK3P51956 506 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CLDN2P57739 230 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ARF5P84085 180 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 RAB6CQ53S08 254 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CARD16Q5EG05 197 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 MYLKQ15746 1914 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 GFPT2O94808 682 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 SEMG2Q02383 582 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CDO1Q16878 200 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 HS1BP3Q53T59 392 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF677Q86XU0 584 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 OR4C6Q8NH72 309 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CRELD1Q96HD1 420 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 NRSN2Q9GZP1 204 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 GANQ9H2C0 597 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CAAP1Q9H8G2 361 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ACTL7AQ9Y615 435 aa20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 FFAR2O15552 330 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 PIAS2O75928 621 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ADRB3P13945 408 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ITGB7P26010 798 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 L1CAMP32004 1257 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 ADRA1BP35368 520 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 DAB2P98082 770 aa19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CXCL3-201ENST00000296026 CDR2Q01850 454 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms