RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 AVPR1AP37288 418 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 LINC00523Q86TU6 105 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PCED1BQ96HM7 432 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SERPINI1Q99574 410 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 KIFC1Q9BW19 673 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RRN3Q9NYV6 651 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 STK39Q9UEW8 545 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 LRIG2O94898 1065 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 VCLP18206 1134 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 GLRBP48167 497 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PGGT1BP53609 377 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ADAM17P78536 824 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PRKAA1Q13131 559 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC12A1Q13621 1099 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 MFN1Q8IWA4 741 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 USP33Q8TEY7 942 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PSMD3O43242 534 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 GRID2O43424 1007 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PEX1O43933 1283 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 DDHD2O94830 711 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TFEBP19484 476 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CXCR3P49682 368 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NAGLUP54802 743 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TMC7Q7Z402 723 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 KYQ8NBH2 561 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 NUF2Q9BZD4 464 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 DNAJB2P25686 324 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 LHX1P48742 406 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 MMEL1Q495T6 779 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 LCA5Q86VQ0 697 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 DSELQ8IZU8 1212 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 STYXQ8WUJ0 223 aa22.96■■□□□ 1.27
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ACTR1B-201ENST00000289228 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.96■■□□□ 1.27
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ACTR1B-201ENST00000289228 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 CNTD1Q8N815 330 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 ICA1LQ8NDH6 482 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 DPF3Q92784 378 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 TRIM4Q9C037 500 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTR1B-201ENST00000289228 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC22A2O15244 555 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 AHSGP02765 367 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PSEN2P49810 448 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 COG7P83436 770 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PCID2Q5JVF3 399 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.95■■□□□ 1.26
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ACTR1B-201ENST00000289228 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 RNF34Q969K3 372 aa22.95■■□□□ 1.26
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ACTR1B-201ENST00000289228 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.95■■□□□ 1.26
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ACTR1B-201ENST00000289228 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 COL6A2P12110 1019 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 GABRB3P28472 473 aa22.94■■□□□ 1.26
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ACTR1B-201ENST00000289228 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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ACTR1B-201ENST00000289228 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CATSPER2Q96P56 530 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTR1B-201ENST00000289228 CDRT15Q96T59 188 aa22.94■■□□□ 1.26
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