RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.85■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 OCEL1Q9H607 264 aa16.85■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.85■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PADI4Q9UM07 663 aa16.85■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 LMO7DNF2Z398 122 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ATP9BO43861 1147 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 CTSLP07711 333 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 OXCT1P55809 520 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 SULT2A1Q06520 285 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 FGL2Q14314 439 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZVU0 165 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 USP7Q93009 1102 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM74Q96NL1 305 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PDZD2O15018 2839 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RAD51BO15315 384 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 F13A1P00488 732 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RABIFP47224 123 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TBX4P57082 545 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CCL7P80098 99 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PKP1Q13835 747 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TATDN2Q93075 761 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC61Q9BV99 259 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SPASTQ9UBP0 616 aa16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 A1L4Q6 167 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PDGFRAP16234 1089 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DCTP40126 519 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DAOAP59103 153 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CUL4BQ13620 913 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A1Q13621 1099 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FHL5Q5TD97 284 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RESP18Q5W5W9 173 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SCML4Q8N228 414 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM159Q96B96 161 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TBATAQ96M53 351 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DNAI2Q9GZS0 605 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.82■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RNF103O00237 685 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH8O95206 1070 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KRT7P08729 469 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ITGB7P26010 798 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PLK1P53350 603 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RAD23BP54727 409 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC8A3P57103 927 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf61Q13536 156 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DLG2Q15700 870 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KYQ8NBH2 561 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 EPAS1Q99814 870 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CLPBQ9H078 707 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DMAC2Q9NW81 257 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 HIVEP1P15822 2718 aa16.81■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 AGRPO00253 132 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 IKBKBO14920 756 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 YY2O15391 372 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KLRC4O43908 158 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA6P08133 673 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LIFP15018 202 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF18P17022 549 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 COL8A1P27658 744 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NOS2P35228 1153 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK10P53779 464 aa16.8■□□□□ 0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MLLT10P55197 1068 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms