RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 APPL2Q8NEU8 664 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 HIC2Q96JB3 615 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF560Q96MR9 790 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CATSPER2Q96P56 530 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ASLP04424 464 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NAGLUP54802 743 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF169Q8NCN4 708 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC11Q96DB2 347 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 MPP4Q96JB8 637 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PKP2Q99959 881 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 OCEL1Q9H607 264 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 UNCXA6NJT0 531 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NMBRP28336 390 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIK4Q16099 956 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NADK2Q4G0N4 442 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM198Q66K66 360 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF181Q9P0P0 153 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TMCO1Q9UM00 188 aa22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BRB1 525 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CFLARO15519 480 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 STRNO43815 780 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PNPLA4P41247 253 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB17Q13105 803 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A1Q13621 1099 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 APOFQ13790 326 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 KIZQ2M2Z5 673 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 VAT1Q99536 393 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSS2Q9NR19 701 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TSC2P49815 1807 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD19C9JJ37 291 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 AP3B1O00203 1094 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RECQL4O94761 1208 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NFKB1P19838 968 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB2P25686 324 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFV1P49821 464 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ART3Q13508 389 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NPWQ8N729 165 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM32Q8TC27 787 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF217Q8TC41 542 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 OTUD5Q96G74 571 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 KIFC1Q9BW19 673 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF19AQ9NV58 838 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PADI4Q9UM07 663 aa22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CXCL11O14625 94 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NPR3P17342 541 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CNBD2Q96M20 576 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 BEST1O76090 585 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 FYNP06241 537 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TPI1P60174 286 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT2Q10471 571 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NOTUMQ6P988 496 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 DLK2Q6UY11 383 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF24Q9UPV7 400 aa22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 I6L893 689 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 DLX3O60479 287 aa22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms