RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 VPS28Q9UK41 221 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM92AA1XBS5 289 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 WASH3PC4AMC7 463 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 INSIG1O15503 277 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LILRB3O75022 631 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GCATO75600 419 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RHOP08100 348 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NUDT17P0C025 328 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ADRA1DP25100 572 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CD70P32970 193 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LSP1P33241 339 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MSH2P43246 934 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GLRBP48167 497 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NR2C2P49116 596 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 WNT3AP56704 352 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPP2R2AP63151 447 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC3Q13217 504 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HAPLN3Q96S86 360 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HMX2A2RU54 273 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 AXIN1O15169 862 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PEX11BO96011 259 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM163BP0C2L3 166 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SERPINB6P35237 376 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GPM6BQ13491 265 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SGF29Q96ES7 293 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NDNQ99608 321 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NOD2Q9HC29 1040 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ADH1AP07327 375 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CSKP41240 450 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARSDP51689 593 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MPP1Q00013 466 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TNS4Q8IZW8 715 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TTC17Q96AE7 1141 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HDAC11Q96DB2 347 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TRABDQ9H4I3 376 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TLE6Q9H808 572 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARL5AQ9Y689 179 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RHOCP08134 193 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 INHBAP08476 426 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GNA12Q03113 381 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CDH18Q13634 790 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LILRA6Q6PI73 481 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MAML1Q92585 1016 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EXOC4Q96A65 974 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RMDN1Q96DB5 314 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IL37Q9NZH6 218 aa6.68□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms