RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AopepQ8BXQ6 817 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppa2Q91VM9 330 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MycbpQ9EQS3 103 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ThraP63058 492 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col6a2Q02788 1034 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trmt1Q3TX08 663 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam35aQ3UEN2 891 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmed1Q3V009 227 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Papss1Q60967 624 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Samd3Q8C4H2 520 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc47a1Q8K0H1 567 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrg2Q8R182 198 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf426Q8R1D1 550 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NlnQ91YP2 704 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lpgat1Q91YX5 370 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd151O35566 253 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmc3O88685 442 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Coro1aO89053 461 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxc13P50207 328 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdlim7Q3TJD7 457 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gdpd4Q3TT99 632 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp438Q8BFX2 798 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnksr3Q8BMA3 555 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osbpl6Q8BXR9 959 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TdrpQ8C5P7 182 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr26Q8C6G8 641 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Parp9Q8CAS9 866 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt5Q9R0N5 386 aa13□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Maml3D4QGC2 1135 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp882E9Q4R4 555 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GcP21614 476 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pou2f2Q00196 463 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr6a1Q64249 495 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sytl5Q80T23 753 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam29Q811Q4 763 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf879Q8BI99 563 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf5Q8C092 801 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb13Q91Y06 796 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chmp1b1Q99LU0 199 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acox2Q9QXD1 681 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dyrk1bQ9Z188 629 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dlg5E9Q9R9 1921 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prkag1O54950 330 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RbfaQ6P3B9 350 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sfr1Q8BP27 319 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HpgdQ8VCC1 269 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mark1Q8VHJ5 795 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgpra2Q91WW4 305 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcrs1Q99L90 462 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubxn6Q99PL6 442 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PllpQ9DCU2 182 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scamp5Q9JKD3 235 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo17Q9QZM8 286 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6408J3QNG1 320 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8926L7MUE8 181 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrp1P97333 923 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S100a13P97352 98 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dok6Q2MHE5 331 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim17Q7TPM3 477 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BoraQ8BS90 525 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam32Q8K410 754 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irak4Q8R4K2 459 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efcab9Q9DAM2 216 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osbpl10S4R1M9 766 aa12.99□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ism2D3Z6A3 493 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctnnd2O35927 1247 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gp6P0C191 313 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nab1Q61122 486 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GnasQ6R0H7 1133 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vwa2Q70UZ7 791 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtmr12Q80TA6 747 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Creb3l2Q8BH52 521 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epn2Q8CHU3 595 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trappc5Q9CQA1 188 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Coro1cQ9WUM4 474 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc4a11A2AJN7 862 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifi213D3Z5G0 586 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd247P24161 164 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epas1P97481 874 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ChukQ60680 745 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspa1aQ61696 641 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ckap2lQ7TS74 745 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il17reQ8BH06 637 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp719Q8BIV1 735 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgrf1Q8VEC3 908 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sike1Q9CPR7 207 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sned1Q70E20 1403 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sash1P59808 1230 aa12.98□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sephs2P97364 452 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.1 ms