RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MAP6	Q96JE9	813 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINB12	Q96P63	405 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	RIT2	Q99578	217 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MEIS3	Q99687	375 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	STRA6	Q9BX79	667 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	COPRS	Q9NQ92	184 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	KIAA0232	Q92628	1395 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072		A8MXQ7	604 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072		K7ERQ8	282 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	RXRB	P28702	533 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINB9	P50453	376 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ERVK-21	P61565	698 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	COPZ1	P61923	177 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ABR	Q12979	859 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	NR1H3	Q13133	447 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	STX5	Q13190	355 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIP10	Q15642	601 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	KYNU	Q16719	465 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	FJX1	Q86VR8	437 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TMC8	Q8IU68	726 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	GPR65	Q8IYL9	337 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	THRSP	Q92748	146 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MAGED4	Q96JG8	741 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MFRP	Q9BY79	579 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CD300A	Q9UGN4	299 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SNX7	Q9UNH6	387 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ABCC4	O15439	1325 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MBD5	Q9P267	1494 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	BLACE	A4D250	179 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM172BP	A6NC97	362 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ALOX15B	O15296	676 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ULK1	O75385	1050 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	GDF11	O95390	407 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	PHKG2	P15735	406 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	GRK3	P35626	688 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MAGEA1	P43355	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	GSTM5	P46439	218 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ALDH3A2	P51648	485 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	AKR1D1	P51857	326 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SCAND1	P57086	179 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	XIAP	P98170	497 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ADAM15	Q13444	863 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SNX17	Q15036	470 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TRADD	Q15628	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	KIAA1191	Q96A73	305 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	FMO2	Q99518	471 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	IL25	Q9H293	177 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TARM1	B6A8C7	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	KBTBD13	C9JR72	458 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	KLRF2	D3W0D1	207 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072		H0YIN7	160 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072		J3QRK9	145 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TM9SF1	O15321	606 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	UGT1A9	O60656	530 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	EFCAB14	O75071	495 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	TFAP2A	P05549	437 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NECAP1-222	ENST00000640072	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41

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