RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CHAD	O15335	359 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TSPAN9	O75954	239 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	APOA4	P06727	396 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CD48	P09326	243 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	GRIA4	P48058	902 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	GTF2A2	P52657	109 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	GK3P	Q14409	553 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SURF1	Q15526	300 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	EBF1	Q9UH73	591 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ACOT9	Q9Y305	439 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SCN9A	Q15858	1988 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NOTO	A8MTQ0	251 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TIMM44	O43615	452 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CSH1	P0DML2	217 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CSH2	P0DML3	217 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	PCNA	P12004	261 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TPH1	P17752	444 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	PCSK6	P29122	969 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SFN	P31947	248 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CDKN2B	P42772	138 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	RAP1GAP	P47736	663 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	KCNK10	P57789	538 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	COPZ1	P61923	177 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	KCTD2	Q14681	263 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	LRRC38	Q5VT99	294 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ERO1B	Q86YB8	467 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NETO2	Q8NC67	525 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	FANCE	Q9HB96	536 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NYAP2	Q9P242	653 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		12.33	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	DNASE1L3	Q13609	305 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	DPYS	Q14117	519 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	NAT9	Q9BTE0	207 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ZNF358	Q9NW07	568 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ATP8B3	O60423	1300 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	KCNK1	O00180	336 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	PLIN3	O60664	434 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CCNK	O75909	580 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ADORA2B	P29275	332 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CSHL1	Q14406	222 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	P3H2	Q8IVL5	708 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ADI1	Q9BV57	179 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	SERPINI2	O75830	405 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	KCNA2	P16389	499 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	PAM	P19021	973 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	GSS	P48637	474 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	DMC1	Q14565	340 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CYP2A13	Q16696	494 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CNPY3	Q9BT09	278 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	EHD1	Q9H4M9	534 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	VWA5A	O00534	786 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PXN-222	ENST00000637624	ALOX5	P09917	674 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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