RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 STK32AQ8WU08 396 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NOX5Q96PH1 765 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GSDMAQ96QA5 445 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA4CQ9C0C4 833 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMA7O14818 248 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PMM2O15305 246 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP12O43422 761 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NEBLO76041 1014 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSLP07711 333 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA3P32297 505 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 IRAK1P51617 712 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 AUHQ13825 339 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6B2Q6IFH4 312 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GCNT7Q6ZNI0 430 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB106AQ8N104 65 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 LMO3Q8TAP4 145 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ARRDC3Q96B67 414 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP63Q96MT8 703 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP23Q9BVJ7 150 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DPH1Q9BZG8 443 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 USP29Q9HBJ7 922 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GDPD2Q9HCC8 539 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NNZ2 444 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ESM1 405 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 P4HA2O15460 535 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GIMD1P0DJR0 217 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SRCP12931 536 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.082e-14■■□□□ 13.1
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CAPNS1-217ENST00000629983 VAC14Q08AM6 782 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZSR6 202 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM110Q86TL2 294 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM181AQ8N9Y4 354 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCE1Q969G3 411 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 KREMEN1Q96MU8 473 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CPED1A4D0V7 1026 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAMP1O15126 338 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN11O75508 207 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOCP08134 193 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NME3Q13232 169 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCLQ13371 301 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SEL1L3Q68CR1 1132 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 EHBP1Q8NDI1 1231 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCL3Q9NQ33 180 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SATB2Q9UPW6 733 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51B4Q9Y5P0 310 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 HS3ST4Q9Y661 456 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAP91O60641 907 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GRAP2O75791 330 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-CO1P00395 513 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PRNPP04156 253 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 C6P13671 934 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GNA15P30679 374 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ISXQ2M1V0 245 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXR1Q6PIV2 292 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT43Q96FT9 208 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SIK2Q9H0K1 926 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR70Q9NW82 654 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-217ENST00000629983 MGAQ8IWI9 3026 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 B8ZZF3 427 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BM21 787 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RRM1P23921 792 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MEA1Q16626 185 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKN3Q16667 212 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST14Q8NCH0 376 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TMIEQ8NEW7 156 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A12Q8NGT7 310 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF606Q8WXB4 792 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R16AQ96I34 528 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CLMPQ9H6B4 373 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HS3ST2Q9Y278 367 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 U3KQA8 63 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ERQ8 282 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH4P55283 916 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ISM2Q6H9L7 571 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL10Q6JEL2 608 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf80Q86SX3 495 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC9Q92623 222 aa28■■■□□ 2.07
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