RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 KCNH6Q9H252 994 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC19Q9H756 370 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PPCSQ9HAB8 311 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SCINQ9Y6U3 715 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PR48 441 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TLDC2A0PJX2 215 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PRSS38A1L453 326 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GMNCA6NCL1 334 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 FZD9O00144 591 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFAB1O14561 156 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 SPOPO43791 374 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 SLC25A27O95847 323 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 FAM107AO95990 144 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 NUDT17P0C025 328 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 TRIM49CP0CI26 452 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MYBL2P10244 700 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 RARGP13631 454 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 TNNI1P19237 187 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 NR1D1P20393 614 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ABCB4P21439 1286 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 BMP5P22003 454 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MAPK4P31152 587 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 HSD17B3P37058 310 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 ACTR2P61160 394 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 MGAT5Q09328 741 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TFDP1Q14186 410 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 WDR78Q5VTH9 848 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DENND2CQ68D51 928 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DUPD1Q68J44 220 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 VRK3Q8IV63 474 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GPR88Q9GZN0 384 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MIS12Q9H081 205 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 THAP2Q9H0W7 228 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PORCNQ9H237 461 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF302Q9NR11 478 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 COL20A1Q9P218 1284 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 RSPH14Q9UHP6 348 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 CEP83Q9Y592 693 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE12BA1L429 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DIRC3C9JPN6 131 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MYO1CO00159 1063 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CXCL11O14625 94 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TTI1O43156 1089 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MED7O43513 233 aa4.75□□□□□ -1.65
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