RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571881.2

CLDN7-204, Transcript of claudin 7, human

TSL 3 BASIC

Gene CLDN7, Length 735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLDN7-204	ENST00000571881	ACSL1	P33121	698 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ZBTB16	Q05516	673 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ARID5B	Q14865	1188 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ARTN	Q5T4W7	220 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	FRS2	Q8WU20	508 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	FOXJ1	Q92949	421 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	MAGEH1	Q9H213	219 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	USP34	Q70CQ2	3546 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	BUB1	O43683	1085 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SEMA4F	O95754	770 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ZNF806	P0C7X5	589 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	TCF4	P15884	667 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	GOT1	P17174	413 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	MAOB	P27338	520 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ARL4A	P40617	200 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ARF5	P84085	180 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	KRT81	Q14533	505 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	ACAP1	Q15027	740 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SYT12	Q8IV01	421 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	SCML1	Q9UN30	329 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CLDN7-204	ENST00000571881	RASA4B	C9J798	803 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881		H3BRJ5	948 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	PLK4	O00444	970 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	RASA4	O43374	803 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	FSBP	O95073	299 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	PCK1	P35558	622 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	CLCN6	P51797	869 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	SEMA3B	Q13214	749 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	RFX8	Q6ZV50	586 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	HMCES	Q96FZ2	354 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	FAM129B	Q96TA1	746 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	NENF	Q9UMX5	172 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	GDF9	O60383	454 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	C5AR1	P21730	350 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	KCNA4	P22459	653 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	TGM1	P22735	817 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	IL1R2	P27930	398 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	HTR7	P34969	479 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	DPP6	P42658	865 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	METAP1	P53582	386 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	MESD	Q14696	234 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	TC2N	Q8N9U0	490 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	EDEM2	Q9BV94	578 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	SGK2	Q9HBY8	427 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	DYRK4	Q9NR20	520 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	DONSON	Q9NYP3	566 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	TMEM131	Q92545	1883 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	DFFA	O00273	331 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	ZMPSTE24	O75844	475 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	IGLV3-19	P01714	112 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CLDN7-204	ENST00000571881	TMEM253	P0C7T8	217 aa		18.68	■□□□□ 0.58

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