RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC31Q6UY01 552 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLRX5Q86SX6 157 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EID2Q8N6I1 236 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHST14Q8NCH0 376 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARRDC3Q96B67 414 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GANQ9H2C0 597 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FZD3Q9NPG1 666 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDF3Q9NR23 364 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRN3Q9NYV6 651 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 LHX6Q9UPM6 363 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYCE3A1L190 88 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ENC1O14682 589 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCF2LO15068 1137 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC31A1O15431 190 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFSF14O43557 240 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 LATO43561 262 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGA12O60330 932 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDH8O95206 1070 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRNA3P32297 505 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACVRL1P37023 503 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GABRB2P47870 512 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NXPH1P58417 271 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R38P59533 333 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FMO1Q01740 532 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 BNIP3Q12983 259 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PROSER1Q86XN7 944 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NT5C3BQ969T7 300 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKA1Q96BD8 255 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC114Q96M63 670 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALN1Q9BXU9 219 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 STK33Q9BYT3 514 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPY26PQ9H489 355 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DYRK4Q9NR20 520 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAXQ9Y2V3 346 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQU0 124 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM72CH0Y354 149 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLR4O00206 839 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALOX15BO15296 676 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FFAR2O15552 330 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC7A4O43246 635 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 LEFTY1O75610 366 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 F9P00740 461 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRNPP04156 253 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPM2P07951 284 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRNB2P17787 502 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOX5P35711 763 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCNN1AP37088 669 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLDN2P57739 230 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDR2Q01850 454 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP4F3Q08477 520 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms