RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 SERPINB11Q96P15 392 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 INSIG1O15503 277 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CACNG3O60359 315 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LEFTY1O75610 366 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LRIG2O94898 1065 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TUBB4AP04350 444 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CISD3P0C7P0 127 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CD6P30203 668 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FANCCQ00597 558 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FMO1Q01740 532 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MESDQ14696 234 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PTPRNQ16849 979 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DACH1Q9UI36 760 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 VPS51Q9UID3 782 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 OR1A2Q9Y585 309 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MUSKO15146 869 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MOCS3O95396 460 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 GNA14O95837 355 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CD48P09326 243 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 AMPD1P23109 780 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 P2RY2P41231 377 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CLCN6P51797 869 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 OGDHQ02218 1023 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 GCNT1Q02742 428 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ODF2Q5BJF6 829 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ABCG4Q9H172 646 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PQU0 124 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 KCNK1O00180 336 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 AKR1B10O60218 316 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 GOT1P17174 413 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 CST6Q15828 149 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 PCSK7Q16549 785 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ZSCAN26Q16670 478 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 AMZ1Q400G9 498 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 PMS2CLQ68D20 193 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 USP53Q70EK8 1073 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 SRLQ86TD4 932 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 XYLT1Q86Y38 959 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 AADATQ8N5Z0 425 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ARRDC3Q96B67 414 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ZBTB9Q96C00 473 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 CHP1Q99653 195 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 IGLON5A6NGN9 336 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 E9PAM4 449 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 KCNK5O95279 499 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 OLFM2O95897 454 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 PRB1P04280 392 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 JUPP14923 745 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 CHRNB2P17787 502 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 SOX5P35711 763 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 C21orf59P57076 290 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 DAB2P98082 770 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-212ENST00000548567 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms