RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.86□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 B8ZZF3 427 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 SCAMP1O15126 338 aa11.85□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 C6P13671 934 aa11.85□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.85□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 IGLV3-25P01717 112 aa11.84□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 ZNF284Q2VY69 593 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 FBXL22Q6P050 247 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.84□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 PARGQ86W56 976 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 TMIEQ8NEW7 156 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 WDR48Q8TAF3 677 aa11.84□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 SATB2Q9UPW6 733 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.84□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM1-211ENST00000528484 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.83□□□□□ -0.51
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CMTM1-211ENST00000528484 K7ESM1 405 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 SLC28A2O43868 658 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 HSF2BPO75031 334 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 TCEA3O75764 348 aa11.83□□□□□ -0.52
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CMTM1-211ENST00000528484 RABIFP47224 123 aa11.83□□□□□ -0.52
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CMTM1-211ENST00000528484 LRRC31Q6UY01 552 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM110Q86TL2 294 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.83□□□□□ -0.52
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CMTM1-211ENST00000528484 MED8Q96G25 268 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 FAM81BQ96LP2 452 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 IL12RB2Q99665 862 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 SYNCQ9H7C4 482 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 IL36AQ9UHA7 158 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM1-211ENST00000528484 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.83□□□□□ -0.52
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