RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CHST14Q8NCH0 376 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-205ENST00000527952 WDCPQ9H6R7 721 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-205ENST00000527952 MPP6Q9NZW5 540 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-205ENST00000527952 VPS51Q9UID3 782 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-205ENST00000527952 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 TMIEQ8NEW7 156 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC114Q96M63 670 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 RRN3Q9NYV6 651 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-205ENST00000527952 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.57■■□□□ 1.52
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