RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 HDDC3Q8N4P3 179 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 AADATQ8N5Z0 425 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC114Q96M63 670 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 EPAS1Q99814 870 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 MAGEH1Q9H213 219 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAI1Q9UI46 699 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 PPM1HQ9ULR3 514 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TSPAN4-217ENST00000527644 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 K7ERQ8 282 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ARHGAP33O14559 1287 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF8O76064 485 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 MYO1AQ9UBC5 1043 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRC72A6NJI9 287 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 BNIP3LO60238 219 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 EPHB2P29323 1055 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 MAPK8P45983 427 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 GALCP54803 685 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF214Q8ND24 703 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 C1orf216Q8TAB5 229 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SNX19Q92543 992 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 BIRC7Q96CA5 298 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CEP44Q9C0F1 390 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 FSCN3Q9NQT6 498 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CACNA1EQ15878 2313 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CREB3O43889 395 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 RAMP2O60895 175 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 FSBPO95073 299 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 HTR7P34969 479 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ACVRL1P37023 503 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ARF5P84085 180 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMA3BQ13214 749 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM14Q14142 442 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 KIAA0895LQ68EN5 471 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 C22orf39Q6P5X5 142 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 OR2A12Q8NGT7 310 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 OR2T34Q8NGX1 318 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 NCAPGQ9BPX3 1015 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM7Q9C029 511 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SARDHQ9UL12 918 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 HPCAL4Q9UM19 191 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A087X0T9 212 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM47DPA6NHR8 397 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 WASH4PA8MWX3 477 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM228BP0C875 321 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 DRD3P35462 400 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ERMARDQ5T6L9 678 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 NCEH1Q6PIU2 408 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM131CQ96AQ9 280 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 OSGEPQ9NPF4 335 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CHD5Q8TDI0 1954 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDH15Q96QU1 1955 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC7A4O43246 635 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CD27P26842 260 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 CHRNA3P32297 505 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ACAP1Q15027 740 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 UAP1L1Q3KQV9 507 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PPM1JQ5JR12 505 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 TMIEQ8NEW7 156 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 OR14C36Q8NHC7 312 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 AP4E1Q9UPM8 1137 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 SPTBN2O15020 2390 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PRPSAP2O60256 369 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHV4-34P06331 123 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 MIPP30301 263 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 METAP1P53582 386 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ADPRHP54922 357 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4-217ENST00000527644 OR8K1Q8NGG5 319 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms