RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A0B4J203	849 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CA12	O43570	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFPL2	O75678	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACSL3	O95573	720 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARSB	P15848	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HTR1B	P28222	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HLA-F	P30511	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR3A3	P47888	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADCY7	P51828	1080 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	NKX3-2	P78367	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	IRX4	P78413	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GAD2	Q05329	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DMPK	Q09013	629 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	BST1	Q10588	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	COX10	Q12887	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	BNIP3	Q12983	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM29	Q14134	588 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDK2	Q15119	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAF5	Q15542	800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LIX1	Q8N485	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CPT1B	Q92523	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A087WXM4	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	COPE	O14579	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIMBP2	O15034	1052 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC37A4	O43826	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FYN	P06241	537 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RET	P07949	1114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC7A1	P30825	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CETN2	P41208	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPIL2	Q13356	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HIC1	Q14526	733 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	WTAP	Q15007	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AMHR2	Q16671	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBE2S	Q16763	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SHC3	Q92529	594 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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