RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 MAPK6Q16659 721 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LIN9Q5TKA1 542 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 USP45Q70EL2 814 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MTSS1LQ765P7 747 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TTC7BQ86TV6 843 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 UROC1Q96N76 676 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MNTQ99583 582 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 BTBD18B2RXH4 712 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 F8W810 466 aa7.37□□□□□ -1.23
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PDE4D-222ENST00000514552 PTGESO14684 152 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TADA2AO75478 443 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 THP07101 528 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 RAP2AP10114 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CYP11B2P19099 503 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 HK1P19367 917 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 FPR1P21462 350 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MGAT1P26572 445 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 RPA1P27694 616 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ALDH1A3P47895 512 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC10P48553 1259 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CTXN1P60606 82 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 RAB39AQ14964 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 NAB2Q15742 525 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD5Q16401 504 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ME3Q16798 604 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TFAP2CQ92754 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 KIFAP3Q92845 792 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 KAT5Q92993 513 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MYADMQ96S97 322 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MRI1Q9BV20 369 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MIOSQ9NXC5 875 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CDH7Q9ULB5 785 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC3O43617 180 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 RECQL4O94761 1208 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PRKCBP05771 671 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 OR52Z1P0C646 297 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 STARD6P59095 220 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 DSC2Q02487 901 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PALB2Q86YC2 1186 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 DRC7Q8IY82 874 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PJA1Q8NG27 643 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 TMX3Q96JJ7 454 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 IFT74Q96LB3 600 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 APOL6Q9BWW8 343 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 RAB34Q9BZG1 259 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MTRRQ9UBK8 725 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LAD1O00515 517 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PI15O43692 258 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 MED24O75448 989 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 LARGE1O95461 756 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 GTF2H3Q13889 308 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PDIA5Q14554 519 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 CSRP2Q16527 193 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 XKR4Q5GH76 650 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-222ENST00000514552 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.35□□□□□ -1.23
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