RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 LXNQ9BS40 222 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RUSC1Q9BVN2 902 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 LRMDAQ9H2I8 198 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM96AQ9H5X1 160 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SAR1AQ9NR31 198 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CNTN3Q9P232 1028 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1B0GTW7 788 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NRP1O14786 923 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PSTPIP1O43586 416 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KDM1AO60341 852 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF8O76064 485 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SP9P0CG40 484 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PYGMP11217 842 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KELP23276 732 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ETFBP38117 255 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC11A2P49281 568 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CCT8P50990 548 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 BASP1P80723 227 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PTK6Q13882 451 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB33AQ14088 237 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 STILQ15468 1287 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ANO4Q32M45 955 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM50Q86XT4 487 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT35Q92764 455 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HAS1Q92839 578 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HAUS1Q96CS2 278 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf70Q9BRQ4 267 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM192AQ9GZU8 254 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF19AQ9NV58 838 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ACKR2O00590 384 aa4.01□□□□□ -1.77
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ANKRD28-213ENST00000498524 FGFR1P11362 822 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 BLKP51451 505 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CASP5P51878 434 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 BCAT1P54687 386 aa4.01□□□□□ -1.77
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ANKRD28-213ENST00000498524 LAMB3Q13751 1172 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 Q4G0T1 1027 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF677Q86XU0 584 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KCT2Q8NC54 265 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF398Q8TD17 642 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GAB3Q8WWW8 586 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC14L1Q92503 715 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ALG3Q92685 438 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ASIC4Q96FT7 647 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC39A13Q96H72 371 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM237Q96Q45 408 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC1Q99614 292 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CHRDQ9H2X0 955 aa4.01□□□□□ -1.77
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ANKRD28-213ENST00000498524 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.01□□□□□ -1.77
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ANKRD28-213ENST00000498524 FLRT2O43155 660 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NOL3O60936 208 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CALB1P05937 261 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ASGR2P07307 311 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ABHD2P08910 425 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CD19P15391 556 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HDCP19113 662 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 EPHB2P29323 1055 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MPLP40238 635 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RAD52P43351 418 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RANBP1P43487 201 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC11A1P49279 550 aa4.01□□□□□ -1.77
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