RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEC1	O60732	1142 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SDC3	O75056	442 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-CO3	P00414	261 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ASL	P04424	464 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT13	P13646	458 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA1	P21709	976 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC8A1	P32418	973 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH10	P35580	1976 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GCLM	P48507	274 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC11A2	P49281	568 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL4D	P49703	201 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP7	P51809	220 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPH1	P58417	271 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F1	Q01094	437 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD4	Q9ULV1	537 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM131	Q92545	1883 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PR77	199 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT9A	O14904	365 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK10	O43240	276 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC28A2	O43868	658 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CUTA	O60888	179 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MOCS3	O95396	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	LATS1	O95835	1130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MPO	P05164	745 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CSK	P41240	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR5	P51681	352 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRE	P78334	506 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL4B	Q13620	913 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH18	Q13634	790 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6D	Q14210	128 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	STAT4	Q14765	748 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	WBP1	Q96G27	269 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511		B8ZZF3	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PDXK	O00764	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	IRAK2	O43187	625 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP6R2	O75170	966 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1B	P01584	269 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FURIN	P09958	794 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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