RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2A12Q8NGT7 310 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CNPY3Q9BT09 278 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SARDHQ9UL12 918 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CBX4O00257 560 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 LATO43561 262 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 GJB6O95452 261 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SERPINC1P01008 464 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PRNPP04156 253 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 L1CAMP32004 1257 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRNA3P32297 505 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 NR1I3Q14994 352 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 OR7D4Q8NG98 312 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC53A6NM62 1247 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SH3BP5O60239 455 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 ZMPSTE24O75844 475 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 LRIG2O94898 1065 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM16O95361 564 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 GZMAP12544 262 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 RRM1P23921 792 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 C21orf59P57076 290 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 ASIC2Q16515 512 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB6CQ53S08 254 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 FIGNQ5HY92 759 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 NLRP14Q86W24 1093 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 NAXDQ8IW45 347 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DRC7Q8IY82 874 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEH1Q9H213 219 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PARVAQ9NVD7 372 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX11Q9Y5W9 270 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 K7ERQ8 282 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 BNIP3LO60238 219 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PRKCIP41743 596 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CNTN1Q12860 1018 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 EFHC2Q5JST6 749 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 NEK5Q6P3R8 708 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 LINGO4Q6UY18 593 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PLPP6Q8IY26 295 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC185Q8N715 623 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 MCEEQ96PE7 176 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PREBQ9HCU5 417 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DYRK4Q9NR20 520 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DONSONQ9NYP3 566 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DMTF1Q9Y222 760 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 EPG5Q9HCE0 2579 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SYCE3A1L190 88 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 FLRT2O43155 660 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 CTSKP43235 329 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 AGBL4Q5VU57 503 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM69Q86WT6 500 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP1-211ENST00000492545 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms