RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ALOX12P18054 663 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 BSGP35613 385 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 BLKP51451 505 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2J2P51589 502 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A2P55011 1212 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 MEA1Q16626 185 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PXKQ7Z7A4 578 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL29Q96CT2 875 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TM2D2Q9BX73 214 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 GPR34Q9UPC5 381 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PSAT1Q9Y617 370 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 A6NCN8 305 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SEC14L2O76054 403 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CBX6O95503 412 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINC1P01008 464 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SPARCP09486 303 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 HSF1Q00613 529 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB16Q05516 673 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT3Q14435 633 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PROSER3Q2NL68 480 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf99Q6UX52 265 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PLD5Q8N7P1 536 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SLC32A1Q9H598 525 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ICKQ9UPZ9 632 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM44O43615 452 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 DOK2O60496 412 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PTP4A3O75365 173 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 LCKP06239 509 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF1AP19438 455 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FMO4P31512 558 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA4AP68366 448 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 IP6K1Q92551 441 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PQM1 296 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TTC36A6NLP5 189 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FIBPO43427 364 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PROP1O75360 226 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ADAP00813 363 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 IL1AP01583 271 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 C6P13671 934 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 PROZP22891 400 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CPOXP36551 454 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MLH1P40692 756 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CPA2P48052 419 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM20Q15388 145 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL15Q96M94 604 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MUC13Q9H3R2 512 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 SYNCQ9H7C4 482 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 BRF2Q9HAW0 419 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 AP3D1O14617 1153 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 RGS2P41220 211 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4A11Q02928 519 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 RPE65Q16518 533 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 CCNG2Q16589 344 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GSTA3Q16772 222 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.2□□□□□ -1.1
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