RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 SCMH1Q96GD3 660 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 NFS1Q9Y697 457 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 GABRB3P28472 473 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 NOVP48745 357 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.01□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.01□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 ZNF114Q8NC26 417 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 FEM1CQ96JP0 617 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.01□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 P2RY10O00398 339 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 EDIL3O43854 480 aa3□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 FAM234BA2RU67 622 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 FAM172BPA6NC97 362 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa2.99□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 SCGB1D2O95969 90 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 CH25HO95992 272 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 MYZAPP0CAP1 466 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 CKMT1AP12532 417 aa2.99□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 TYK2P29597 1187 aa2.99□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 ZNF132P52740 706 aa2.99□□□□□ -1.93
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SENP6-210ENST00000487548 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 MTBPQ96DY7 904 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 RGL1Q9NZL6 768 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 PKP3Q9Y446 797 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 A0A0A0MQY5 61 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 VSTM5A8MXK1 200 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
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