RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-208ENST00000482232 THAP4Q8WY91 577 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 Q9N2J8 555 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 FZD3Q9NPG1 666 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 BAG5Q9UL15 447 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PHLPP1O60346 1717 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SHPRHQ149N8 1683 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 HMX3A6NHT5 357 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 MYMKA6NI61 221 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 B4DGG1 531 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 E7EVH7 732 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 MDM4O15151 490 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 POLD2P49005 469 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 GALNT3Q14435 633 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 POSTNQ15063 836 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SLC25A28Q96A46 364 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 NLRP4Q96MN2 994 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ARL15Q9NXU5 204 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CD8B2A6NJW9 211 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TCEA3O75764 348 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ACP5P13686 325 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CHRNA5P30532 468 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ADD2P35612 726 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 OAZ1P54368 228 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 MAPK7Q13164 816 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TIGD6Q17RP2 521 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 GPSM1Q86YR5 675 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PELI3Q8N2H9 469 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TASP1Q9H6P5 420 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 RNF146Q9NTX7 359 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 NLRP1Q9C000 1473 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 GAGE12JA6NER3 117 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SPTLC2O15270 562 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 HOXB2P14652 356 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PMPCAQ10713 525 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CUL4BQ13620 913 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PKP1Q13835 747 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PRKG1Q13976 671 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 LRRC24Q50LG9 513 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SYT13Q7L8C5 426 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 KDM1BQ8NB78 822 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 ATP7AQ04656 1500 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF2I-208ENST00000482232 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 H3BNX3 289 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 INSIG1O15503 277 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 HLA-DQA2P01906 255 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 KLKB1P03952 638 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 TK1P04183 234 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 LYL1P12980 280 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 TYK2P29597 1187 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 AVPR2P30518 371 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 SLC16A2P36021 539 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 PDCLQ13371 301 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF2I-208ENST00000482232 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.02□□□□□ -1.45
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