RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC18Q9H819 358 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FBRSQ9HAH7 460 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RNF181Q9P0P0 153 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NUP50Q9UKX7 468 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ESYT2A0FGR8 921 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SNTNA6NMZ2 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 KLRF2D3W0D1 207 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 H3BMQ9 156 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GFRA2O00451 464 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TBX3O15119 743 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PMM2O15305 246 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SNX2O60749 519 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SNNO75324 88 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TSPAN9O75954 239 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 USP1O94782 785 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MYO1DO94832 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BCL10O95999 233 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CCNA2P20248 432 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ENPP1P22413 925 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BDNFP23560 247 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CIITAP33076 1130 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CHKAP35790 457 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ADCY8P40145 1251 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PSMD8P48556 350 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NRLP54845 237 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 IFITM2Q01629 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PICALMQ13492 652 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GALNT3Q14435 633 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-211ENST00000481115 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 LGSNQ5TDP6 509 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-211ENST00000481115 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 AKAP14Q86UN6 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PALB2Q86YC2 1186 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CNTD1Q8N815 330 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RNF169Q8NCN4 708 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 EXD1Q8NHP7 514 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MZB1Q8WU39 189 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FBXL18Q96ME1 805 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 COG8Q96MW5 612 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PSKH2Q96QS6 385 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TWNKQ96RR1 684 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC9A7Q96T83 725 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.29□□□□□ -1.24
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