RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 OMDQ99983 421 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 GDF3Q9NR23 364 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 DMTF1Q9Y222 760 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 CEP83Q9Y592 693 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.47□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 TENM4Q6N022 2769 aa6.46□□□□□ -1.37
NOP56-212ENST00000480447 A0A1B0GTQ1 180 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 ITGAVP06756 1048 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 GLI1P08151 1106 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 SLC8A1P32418 973 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PRCPP42785 496 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 RXRGP48443 463 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CST6Q15828 149 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 NEK5Q6P3R8 708 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PDZD3Q86UT5 571 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 UBA3Q8TBC4 463 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 UBXN4Q92575 508 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 SMARCE1Q969G3 411 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 SLC35C1Q96A29 364 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 SPAG5Q96R06 1193 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 TCF12Q99081 682 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 THAP9Q9H5L6 903 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.46□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PI4KAP42356 2102 aa6.46□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 MGAQ8IWI9 3026 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 F5H5T6 163 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 M0QYV0 167 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 TLR4O00206 839 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 LATO43561 262 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 IGHV4-34P06331 123 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 JUPP14923 745 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CCR1P32246 355 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CD70P32970 193 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CSKP41240 450 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PLK1P53350 603 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CDK17Q00537 523 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 E2F1Q01094 437 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 BNC1Q01954 994 aa6.45□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.45□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.45□□□□□ -1.38
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NOP56-212ENST00000480447 TMEM110Q86TL2 294 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CCNJLQ8IV13 435 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 UBR7Q8N806 425 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 P2RY11Q96G91 374 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 SLC39A13Q96H72 371 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 SERAC1Q96JX3 654 aa6.45□□□□□ -1.38
NOP56-212ENST00000480447 LMLNQ96KR4 655 aa6.45□□□□□ -1.38
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