RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470980.1

GREB1-208, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene GREB1, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-208ENST00000470980 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ZBTB17Q13105 803 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 MTM1Q13496 603 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PRPSAP1Q14558 356 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TPSAB1Q15661 275 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ANO4Q32M45 955 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 KRT71Q3SY84 523 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PARP15Q460N3 678 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 MSS51Q4VC12 460 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TEX44Q53QW1 395 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 GPR158Q5T848 1215 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 MCUQ8NE86 351 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 USP33Q8TEY7 942 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ASIC4Q96FT7 647 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SH3GL2Q99962 352 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 GBA3Q9H227 469 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CACNA1HO95180 2353 aa9.5□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TLDC2A0PJX2 215 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TMEM221A6NGB7 291 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SMIM23A6NLE4 172 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 M0R296 226 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 MATN3O15232 486 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 RNF40O75150 1001 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 AVILO75366 819 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CLDN11O75508 207 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 RHOP08100 348 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PFKLP17858 780 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 NFKB1P19838 968 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 NUBP1P53384 320 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 EPHA5P54756 1037 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CDH4P55283 916 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SLC7A9P82251 487 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CBX1P83916 185 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CDK16Q00536 496 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TEAD2Q15562 447 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 C5orf22Q49AR2 442 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CHST9Q7L1S5 443 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CROCCP2Q86T23 111 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PALM2Q8IXS6 379 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 LEMD2Q8NC56 503 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PRSS33Q8NF86 280 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ARL8AQ96BM9 186 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TEKT5Q96M29 485 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SERPINB12Q96P63 405 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CCDC77Q9BR77 488 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 PIDD1Q9HB75 910 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.49□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 USP34Q70CQ2 3546 aa9.48□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.48□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 A0A1B0GVM2 712 aa9.48□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.48□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 E7ESA3 106 aa9.48□□□□□ -0.89
GREB1-208ENST00000470980 J3KR12 359 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms