RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 FAM131BQ86XD5 332 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PLPP6Q8IY26 295 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PSMB7Q99436 277 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 AGPAT1Q99943 283 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SPON2Q9BUD6 331 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 EBF2Q9HAK2 575 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 MPP6Q9NZW5 540 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 VPS51Q9UID3 782 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SARDHQ9UL12 918 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 MYO6Q9UM54 1294 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 DMTF1Q9Y222 760 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0D9SEW6 157 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GTQ1 180 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PR77 199 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 H0Y8X5 98 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 TLR4O00206 839 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 KCNK3O14649 394 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SNAP91O60641 907 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ZMPSTE24O75844 475 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PRNPP04156 253 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 FERP16591 822 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 RHOQP17081 205 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 GRK6P43250 576 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 RXRGP48443 463 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 NUMBP49757 651 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 GNA12Q03113 381 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 TYRO3Q06418 890 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 CNTN1Q12860 1018 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 OVGP1Q12889 678 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 STAT4Q14765 748 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 INAVAQ3KP66 663 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 WDR59Q6PJI9 974 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 Q6ZVU0 165 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 IQCHQ86VS3 1027 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM69Q86WT6 500 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 EMC1Q8N766 993 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 C3orf20Q8ND61 904 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 OR7D4Q8NG98 312 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SERAC1Q96JX3 654 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A18Q96N87 628 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 CEP44Q9C0F1 390 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEH1Q9H213 219 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PREBQ9HCU5 417 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 IGF2RP11717 2491 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ZZEF1O43149 2961 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD62A6NC57 917 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRF-210ENST00000463041 K7ERQ8 282 aa7.44□□□□□ -1.22
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