RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 RETSATQ6NUM9 610 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 LINGO4Q6UY18 593 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 CCNYQ8ND76 341 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 MNS1Q8NEH6 495 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 NSMCE1Q8WV22 266 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 OSBPL6Q9BZF3 934 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.96■□□□□ 0.79
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC188H7C350 402 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ZMPSTE24O75844 475 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CCNCP24863 283 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 STK19P49842 368 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ST8SIA6P61647 398 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 FZD5Q13467 585 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 TSGA13Q96PP4 275 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SP110Q9HB58 689 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 HCN2Q9UL51 889 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 BDP1A6H8Y1 2624 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 VCANP13611 3396 aa19.95■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 H7C0C1 242 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 J3KR12 359 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 MTSS1O43312 755 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 RBP3P10745 1247 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 NNMTP40261 264 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ATP5OP48047 213 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ARF5P84085 180 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 LMNB2Q03252 620 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 IL10RBQ08334 325 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SLC20A2Q08357 652 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF234Q14588 700 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 PTPRNQ16849 979 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC105Q8IYK2 499 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CHPFQ8IZ52 775 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SYNPOQ8N3V7 929 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 USP33Q8TEY7 942 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 LRRN4Q8WUT4 740 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 FATE1Q969F0 183 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 RUNDC3BQ96NL0 473 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ACOX2Q99424 681 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 AP1M1Q9BXS5 423 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 HAUS2Q9NVX0 235 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CFAP69A5D8W1 941 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 LIASO43766 372 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 PRAMEF11O60813 436 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 MT-CO1P00395 513 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 DCNP07585 359 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 WASP42768 502 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 AP1B1Q10567 949 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 Q6ZS52 159 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC13Q8IYE1 715 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ALLCQ8N6M5 410 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CEP112Q8N8E3 955 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ATP11CQ8NB49 1132 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 KCNV2Q8TDN2 545 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 C1orf54Q8WWF1 131 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 MRGPRX3Q96LB0 322 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF599Q96NL3 588 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ACTL7AQ9Y615 435 aa19.94■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 MAFKO60675 156 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CHRNA3P32297 505 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CYP1B1Q16678 543 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ACCSLQ4AC99 568 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SDE2Q6IQ49 451 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 PRELID2Q8N945 189 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 SLC35B2Q8TB61 432 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa19.93■□□□□ 0.78
SNHG12-201ENST00000461448 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms