RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LRRK2Q5S007 2527 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 A0A087X0B3 334 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PQ27 194 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PQ64 194 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PQC6 194 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PQM1 296 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 E7ENQ6 273 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TULP2O00295 520 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SPTLC2O15270 562 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 YY2O15391 372 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 BMP15O95972 392 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 HLA-DRAP01903 254 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PRKAR1AP10644 381 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LIFP15018 202 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PDGFRAP16234 1089 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NR1D1P20393 614 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CCKBRP32239 447 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PIK3CAP42336 1068 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ATP1A2P50993 1020 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TBX4P57082 545 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SLC8A3P57103 927 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DLG4P78352 724 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NUCB2P80303 420 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 INCA1Q0VD86 236 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ADIGQ0VDE8 80 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 KLRB1Q12918 225 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DCAF6Q58WW2 860 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RAB41Q5JT25 222 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FAXCQ5TGI0 409 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NEK5Q6P3R8 708 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 Q6ZVU0 165 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LGI2Q8N0V4 545 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FRS2Q8WU20 508 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TAF4BQ92750 862 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CLIC6Q96NY7 704 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CMKLR1Q99788 373 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DYRK4Q9NR20 520 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PIK3R2O00459 728 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FPGTO14772 594 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 MCF2LO15068 1137 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RAD51BO15315 384 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NKX2-8O15522 239 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SPINT1O43278 529 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PRKCGP05129 697 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LCP1P13796 627 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RABIFP47224 123 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FGL2Q14314 439 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DLG2Q15700 870 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PHF19Q5T6S3 580 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SV2AQ7L0J3 742 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PDILTQ8N807 584 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TATDN2Q93075 761 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NKD1Q969G9 470 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RNF34Q969K3 372 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CATSPER2Q96P56 530 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.37□□□□□ -1.23
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